食用菌作为系列产品开发，其前途广阔。有些地方用金针菇作成了金菇饮料；有人把菌类添加于各类糕点，如 茯苓夹饼。用灵芝等菌制成的盆景，更是栩栩如生，如泾阳真菌研究所采用生物学技术造型与传统盆景工艺相结合，制作的灵芝盆景，已成为一种新开发的创汇产品。用菌类盆栽或插瓶，作为一种家庭观赏真菌来代替花卉，其市场广阔。山区有些农民用一种鲜蛤蟆菌子实体能诱杀苍蝇，因为此菌含有使苍蝇神经麻痹的毒素。硫磺菌也具有类似作用，把硫磺菌子实体晒干后，放在室内焚烧，可以驱除蚊、蚋、蠓等害虫。国外用大孢伏草菌制成片剂是一种有特殊用途的生物防治剂，能防止多年层孔菌危害森林。还可使伐木后遗留的树桩、暗根两年内清除。许多大型真菌的代谢产物均有重要经济价值。如云芝，变色多孔菌产生的漆酶能提高生漆的质量，乳菇属的一些种类能合成橡胶物质，变色多孔菌能使固态褐煤液化，有些菇类则可用于生产助鲜剂，进行药物的合成和转化。作为菌类系列产品开发，我国尚处于探索阶段，但已展现出菇类栽培业发展的广阔天地。
    食用菌利用农作物秸秆为原料进行栽培，生产过程中会产生杂菌污染废弃物，生产结束后又剩下大量栽培废料—菌渣。这些废料如果不及时处理，会成为污染源，造成生产环境恶性循环，导致食用菌制种和栽培失败机率增加。特别是规模化生产，不可能采用焚烧和搬离场所等消极处理方法。要使食用菌生产走上生态高效经济循环发展道路，必须开发食用菌菌渣的综合利用，在此基础上形成食用菌—营养食品—大众健康的产业链和农作物秸秆—菌渣饲料—饲养业—有机肥料的农业生态循环链，实现变害为利，变废为宝，节本增益，促进农作物秸秆栽培食用菌产业良性循环和健康持续的发展。
(1) 菌渣生物饲料的开发利用
   栽培食用菌的主要基质棉籽壳、稻麦棉油秸秆、胡桑枝、玉米芯等，含有纤维素、半纤维素和木质素等多糖，在栽培过程中被食用菌分泌的各种酶降解，菌渣中含有丰富的各种易吸收的有机物和矿物质，再经过生物发酵，粗蛋白、粗脂肪含量均比原来的基质高二倍以上，可以做成饲料、饵料或其添加剂，用于猪、牛、羊、鸡、鸭、兔、鱼等动物饲料，替代部分粮食，降低饲养成本。
(2) 菌渣循环利用
利用自然界中无害微生物，对食用菌栽培中的污染物进行堆制和沤制处理，使物料熟化，富集营养，成为用食用菌循环利用的优质基料。即食用菌种植后的菌渣废料，可直接用作另一种食用菌栽培的部分原料，前茬菇的菌丝生长分泌各种酶，对基质起熟化作用，为后茬菇提供速效营养物质。
(3) 菌渣生产绿色肥料
   食用菌栽培废弃物加入无害化的添加剂，生产绿色有机肥料，用绿色肥料给农作物、果林树木施肥，可显著增加土壤有机质，改善土壤物理性状，提高农作物、果林树木的产量和品质，周而复始，转化为循环经济。
(4) 菌渣基质栽培
   随着设施栽培面积的不断扩大，由于大棚内连年种植蔬菜，连作障碍（如病虫害严重、土壤次生盐渍化等）的问题越来越严重，传统的无土栽培由于使用化学营养液或蛭石等基质，存在着栽培成本高，操作难度大，不易推广等缺点。利用丰富的菌渣作为无土栽培基质生产蔬菜，既可显著降低成本，简化操作规程，又便于推广，使蔬菜产量显著提高，达到优质、安全、无公害。

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