用鸡粪猪粪牛粪污泥秸秆等废弃物＋作物秸秆等废弃原料，因各种原料复杂，养分含量各有差异。各种畜禽粪便养分含量也不尽相同，这里不能一一列举单项制作方法。如：用作物秸秆等原料发酵为主时，可填加20%左右的畜禽粪便，用畜禽粪便为主做原料时可填加20%左右的秸秆粉，发酵方法同上所述。如果用酸性较大的原料发酵，在发酵时应填加1-3%左右的石灰粉，以调整酸碱度至中性。用此方法发酵好的有机肥适用于各作物、各种土壤，既可自用，也可加工做成商品肥销售。
 生物有机肥的制作
   以发酵加工后的有机肥料为载体。加入益生菌加工而成的生物有机肥料，是指一种含有益于作物生长的发酵微生物的特定有机肥料，它既具有微生物肥料的功效，又具有有机肥料的作用。应用于农业生产中，具有显著的增产效果。这种肥料制作比较简便。如：利用发酵加工后的干基有机肥料1000公斤，加入1.5%-15%的益生菌，经充分混合、翻倒、拌均，加工制成含菌量≥0.2亿至≥2亿/克的生物有机肥料。
  生物有机肥料是一种完全的肥料，有机质含量十分丰富，不但富含氮、磷、钾等大量元素，还含钙、镁、硫、铁、锰、锌、铜、硼、钼、氯等中微量元素，生物有机肥料中的功能菌即能分解土壤中的矿物磷，又能分解土壤中的矿物钾，释放出磷、钾等多种营养成分，可持久的给农作物提供源源不断的养分。从多年的使用效果来看，生物有机肥的肥效，在各种作物上的验证取得了另人满意的效果。得到了广大农民的认同。随着我国有机农业的快速发展，生物有机肥料越来越展示出具大的市场前景。
制肥场地的选择。
制肥场地应选择地势平坦，靠近水源的背风向阳处，一年四季均可露天制作。
制肥材料的准备
（以1吨干秸秆为例）。①作物秸秆1000公斤。②饼粉20公斤。花生饼、豆饼、棉籽饼、菜籽饼等均可，无饼粉可用10公斤尿素代替。③em益生菌5公斤。
制作方法。
①把作物秸秆（如玉米秆）用粉碎机粉碎或用铡草机切断，一般长度以1-3厘米为宜（麦秸、稻草、树叶、杂草、花生秧、豆秸等可直接使用发酵，但粉碎后发酵效果更佳）。②把粉碎或切断后的秸秆用水浇湿、渗透，秸秆含水量一般掌握在70%左右。③用20公斤饼粉同1公斤菌种拌匀，用手均匀地把拌有菌种的饼粉撒在用水浇过的秸秆表面。用铁锹等工具翻拌一遍，堆成宽2米、高1.5米、长度不限的长条，用塑料布盖严即可。
秸秆腐化过程。
①升温阶段：从常温升到50℃，一般只需一天。②高温阶段：从50-70℃一般只需２天。③降温阶段：从高温度降到50℃以下，一般10天左右，此时秸秆制肥过程基本完成，肥料可直接施用。
秸秆肥腐熟标志。
⑴秸秆变成褐色或黑褐色，湿时用手握之柔软有弹性，干时很脆容易破碎。⑵腐熟后堆体比刚堆时塌陷1/3或1/2。
秸秆肥的施用方法。
⑴秸秆肥一般用作基肥，可潮湿施用。做追肥应覆土。半腐熟的肥料施用于生长期较长的作物，腐熟度高的秸秆肥施用于生长期较短的瓜果蔬菜等作物，沙性地用半腐熟的肥料，黏土地最好施用腐熟度高的肥料。⑵秸秆肥中有机质十分丰富，氮、磷、钾养分较为均衡，还含有各种微量元素，是各种作物、各种土壤都适宜的常用肥料，具有提高产品品质、增加产量的显著效果。
生物肥料的分类:
狭义地生物肥料，是通过微生物生命活动，使农作物得到特定的肥料效应的制品，也被称之为接种剂或菌肥，它本身不含营养元素，不能代替化肥。广义地生物肥料是既含有作物所需的营养元素，又含有微生物的制品，是生物、有机、无机的结合体它可以代替化肥，提供农作物生长发育所需的各类营养元素。生物肥料从其作用上可分为：生物固氮菌(如根瘤菌)；分解土壤有机物菌剂(有机磷细菌肥、综合细菌肥；分解土壤难溶性矿物的菌剂(硅酸盐细菌肥料、无机磷细菌肥料)；抗病与刺激作物生长的菌剂(抗生菌肥料)；从其成分上可分为：单纯生物肥，它本身基本不含营养元素，而是以微生物生命活动的产物改善作物的营养条件，活化土壤潜在肥力，刺激作物生长发育，抵抗作物病虫危害，从而提高作物产量和质量。因而单纯生物肥不能单施，要与有机肥、化肥配合施用才能充分发挥它的效能。如：大豆根瘤菌、磷素活化剂、生物钾肥等。有机-无机-生物复合肥，它是有机肥、无机肥、生物菌剂三结合的肥料制品，既含有作物所需的营养元素，又含有微生物，它可以代替化肥供农作物生长发育。如目前市场销售的生物有机复合肥、绿色食品专用肥、生物有机复合肥等。都是在制造过程中，添加生物菌剂，缩短有机肥的生产周期、增加其速效成分。生物有机肥与传统有机肥的区别在于是工厂化、专业化生产，有人也将这类肥料称之为精制商品有机肥。
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