洁净厂房的建筑平面和空间布局，应具有适当的灵活性。洁 净区的主体结构不宜采用内墙承重。
洁净室的高度以净高控制，净高应以100毫基本模数。
洁净厂房主体结构的耐久性与室内装备和装修水平相协调， 并应具有防火、控制温度变形和不均匀沉陷性能（地震区应符合抗震设计规定）。厂房变形缝应避免穿过洁净区。
对兼有一般生产和洁净生产的综合性厂房，其方案设计和构造的处理，应避免在人流与物流运输以及防火方面对洁净生产带来不利影响。
送、回风管和其他管线需暗敷时，应设置技术夹层、技术夹道或地沟等；穿越极层的竖向管线需暗敷时，宜设置技术竖井。
洁净厂房中对光源有特殊要求的车间 锂电净化厂房，如显像管厂的荧光粉涂覆间、半导体厂房的光刻间食用菌净化厂房，为了防止感光材料的感光 净化厂房，必须使用黄色或红色光源的十万级净化厂房，应满足其特殊要求选用黄色荧光灯或低压钠灯，这类灯具的光通量比一般的荧光灯要低，在设计时需要注意。
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