索莱宝质粒小量提取试剂盒的使用方法
质粒是细胞内的一种环状的小分子dna,是dna重组的常用载体,在dna重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。在质粒提取过程中,多数质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:共价闭合环dna(cccdna)、质粒的两条链没有断裂、超螺旋开环dna(ocdna)、质粒的一条链断裂、松弛的环状分子线形dna(ldna):质粒的两条链均断裂;线性分子质粒dna的分子构型。
质粒小量提取的方法
1.将3~5ml菌液13,000rpm离心30秒收集沉淀(菌体)。 如果用1.5ml或2ml离心管则需反复离心2~3次。
2.倒掉上清,将沉淀(菌体)完全悬浮于100μl悬 浮液(溶液i)中。上清要尽可能去除干净,可用滤纸吸干。沉淀要 用混旋器完全悬浮,否则将直接导致下一步的裂 解不彻底,进而影响质粒dna的产量和纯度。
3.加入150μl裂解液(溶液ii),轻柔地颠倒混匀10 次左右,溶液逐渐变得粘稠、清亮。不可用混旋器剧烈振荡,否则会使质粒dna断裂; 裂解时间不宜超过5分钟,否则会造成染色体dna 的污染及质粒dna的产率降低。
4.加入150μl中和液(溶液iii),轻柔地颠倒混匀10 次左右。 此时可见到白色絮状的染色体dna及细菌碎片。
5.13,000rpm离心8~10分钟,将上清液小心转入一 37个新的1.5ml离心管中,加入0.4ml纯化树脂(使 用前充分混匀),颠倒混匀3分钟。此步是通过离心去除染色体dna及细菌碎片,并使处于高盐状态下的质粒dna与纯化树脂结合。
6.将纯化树脂及上清液的混合物吸入离心纯化柱中,13.000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。
7.将离心纯化柱重新套入废液收集管中,加入600μl 80%异丙醇(或80%乙醇),13.000rpm离心1分 钟,倒掉收集管中的废液。 如果离心纯化柱底部残留有异丙醇(或乙醇),可 用滤纸吸干,否则将影响以后的酶促反应。此步 是洗涤质粒dna中混有的杂质及盐类。
8.重复第7步1~2次,尽可能将杂质去除。
9. 取出离心纯化柱,将其套入一个干净的1.5ml离 心管,开盖放置2~3分钟,将残留的异丙醇(或乙 醇)挥发干净。加入50μl te缓冲液(若用于测序, 则加50μl超纯水)于纯化树脂上,不能粘在管壁 上。室温下放置3分钟后,13,000rpm离心1分钟。 此步是将纯化树脂上的dna洗脱下来。如果对质粒dna的需求量较大,则重复此步骤1~2次,这 样可以获得高产量的质粒dna。te缓冲液或无菌 超纯水的用量视用户对浓度的要求而定。离心纯化柱放入离心管中,若盖不上盖子,亦没有关系,可开盖离心。
10.离心管中收集的液体即是洗脱下来的质粒 dna,取1~2μl电泳(0.8%琼脂糖,120v,15~ 20分钟)检测其纯度并目测定量。 若发现有rna 污染,可加入0.5μl rnase a (10mg/ml),37℃保温30分钟。此操作不影响其 后续实验。
质粒小量提取注意事项
1、使用前请先检查溶液ⅱ和溶液ⅲ是否出现混浊,如有混浊现象,可在37℃水浴中加热几分钟,待溶液恢复澄清后再使用。溶液ⅱ、溶液ⅲ和漂洗液使用后应立即拧紧盖子。
2、洗脱缓冲液体积不应少于50ul,体积过小影响回收效率;洗脱液的ph值对洗脱效率也有影晌,若需要用水做洗脱液应保证其ph值在8.0左右(可用naoh将水的ph值调至此范围),ph值低于7. 0会降低洗脱效率,dna产物应保存在-20℃,以防dna降解。
3、如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应加大菌体使用量,使用5-10ml过夜培养物,同时按照比例增加溶液ⅰ、溶液ⅱ和溶液ⅲ的用量,吸附和洗脱时可以适当的延长时间,以增加提取效率。
4、dna浓度及纯度检测:得到的质粒dna纯度与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。得到的dna可用琼脂糖疑胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。 dna应在od260处有显著吸收峰,od260值为1相当于大约50ug/ml双链dna、 40ug/ml单链dna。od260/od280比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,因为ph值和离子存在会影响吸光值,但并不表示纯度低。
北京索莱宝科技有限公司为生化试剂供应商,专业生产销售生化试剂、生物试剂、细胞培养、试剂盒、实验耗材等产品。质粒小量提取试剂盒是索莱宝自产产品,本试剂盒采用碱裂解法裂解细胞,根据离心吸附柱在高盐状态下特异性地结合溶液中的dna的原理特异性提取质粒dna。 离心吸附柱中采用的硅基质材料能高效、专一地吸附dna,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。 使用本试剂盒提取的质粒dna可适用于各种常规操作,包括酶切、pcr、测序、连接和转化等试验。