填鸭舍与育成鸭舍差不多，要求并不高，建筑比较简单，地面大多采用夯实的泥土，但必须有饮水装置，一般将水槽装在排水沟上，以便使溢出的水能流入沟中。所不同的是，填鸭舍要分隔成若干小圈，每圈面积为12米2，约可容纳50只填鸭，每圈设一扇小门，通向走道。较长的鸭舍，把填饲料间放在中间，把两端各舍的鸭子按次序赶至填饲间填饲。较短的鸭舍可将填饲料间放在任何一端。
目前，我国各地饲养种鸭尚未采用机械化、自动化作业，一般是平地饲养，手工操作。鸭舍有单列式和双列式两种，双列式种鸭舍必须具备两边都有水浴的条件。
种鸭舍的防寒隔热性能要优良，房顶要有天花板或加隔热装置，北墙不能漏风，屋檐高2.6～2.8米，窗与地面面积的比例为1∶8，南窗的面积可比北窗大1倍，南窗离地高60～70厘米，北窗离地高1～1.2米，并设气窗。为使夏季通风良好，北边可开设地脚窗。但不用玻璃，只安装铁条或铅丝网，以防兽害，寒冷季节用油布或塑料布封住，以防漏风。
种鸭舍除设置排水沟外，还要有供种鸭晚间产蛋的处所。单列式种鸭舍，走道在北边，排水沟紧靠走道旁，上盖铁丝网或木条，饮水器放在铁丝网上，南边靠墙的一侧，地势略高，可放置产蛋箱。产蛋箱宽30厘米，长40厘米，用木板钉成，无底，前面较低，供鸭子进出，其他三面高35厘米，箱底垫木屑或切短的干净垫草。每只箱子可供3只蛋用型种鸭或4只肉用型种鸭使用。
我国东南沿海各省饲养蛋鸭，都不用产蛋箱。直接在鸭舍内靠墙壁的各侧，把干草垫高，可供种鸭夜间产蛋之用。这种垫草必须保持干净，而且要高于舍内的地面。双列式种鸭舍，走道在中间，排水沟分别紧靠走道的两侧，在排水沟对面靠墙的一侧，地势稍高，放置产蛋箱或厚垫干草，供种鸭夜间产蛋之用。
种鸭舍必须具有配套的水围供种鸭交配、洗澡之用，如果不具备水面条件，特别是双列式种鸭舍，常常一边有河道，另一边是旱地，在这种条件下，需要挖一条人工的洗浴池，洗浴池的大小和深度根据鸭群数量而定。一般洗浴池宽2.5～3米，深0.5～0.8米，用水泥砌成，不能漏水。
洗浴池挖在运动场的最低处，利于排水，洗浴池和下水道连接处，要修一个沉淀井；在排水时，可将泥沙、粪便等沉淀下来，免得堵塞排水道。种鸭的运动场，如尚未种植遮阴的树木，应搭建凉棚，凉棚的面积与鸭舍面积相似，把在舍外饲喂的料槽放在凉棚下，以防饲料雨天被淋。